CBL - Campus del Baix Llobregat

Projecte llegit

Títol: Reconstrucció de l'arbre filogenètic les Asteràcies dels Països Catalans

Estudiant que ha llegit aquest projecte:

Tutor/Cotutor: CASALS MISSIO, JOAN

Departament: DEAB

Títol: Reconstrucció de l'arbre filogenètic les Asteràcies dels Països Catalans

Data inici oferta: 06-02-2023      Data finalització oferta: 06-04-2023

Estudis d'assignació del projecte:
    GR ENG SIS BIOLÒGICS

Lloc de realització:


En empresa (cal signar un conveni de cooperació)

        Tutor Extern: Pol Fernández i Mató
        Institució/Empresa: Institut botànic de Barcelona

Paraules clau:
filogènia, asteràcies, genòmica, seqüenciació

Descripció del contingut i pla d'activitats:
El projecte consistirà en tres parts: primer l'obtenció de
material d'herbari i/o fresc d'aquells gèneres pels quals no hi
ha informació ja publicada. En segon lloc el treball de
laboratori: extracció d'ADN de les mostres, construcció de
llibreries genòmiques i finalment la hibridació d'aquestes amb el
kit Angiosperms 353 per poder recuperar i enviar a seqüenciar 353
gens de còpia única per cada gènere. Finalment l'anàlisi
bioinformàtic de les dades obtingudes juntament amb les dades ja
publicades per a construir l'arbre filogenètic a nivell de gènere
de totes les Asteràcies del PPCC. Addicionalment es mapejaran
trets l'interès alimentari i/o sanitari dels diferents generes a
la filogènica construïda.

Overview (resum en anglès): This work focuses on the reconstruction of the phylogenetic tree at the genus level of Asteraceae
in the Catalan Countries.
One of the main objectives has been to complete the list of genera, so it has been necessary to carry
out an exhaustive study of the synonymy of the genera, taking into account the nomenclature of
the different floras and databases. Both officially accepted and non-officially accepted species have
been taken to make a comparison and obtain a final result. The samples of the genera have been
treated to obtain useful sequencing data using the Angiosperms353 kit.
The phylogenetic analysis of these genetic data, which constitutes the result of this study, has
allowed us to explore the evolutionary relationships between the genera of Asteraceae in this
specific geographic region. This molecular approach provides a clearer vision of the genetic diversity
and evolution of these plants in the Catalan Countries. The results of this study contribute to the
understanding of biodiversity and the evolutionary history of Asteraceae in this geographical area,
with the aim of having an adequate phylogenetic framework that allows for the analysis of other
types of data (ethnobotanical and cytogenetic, among others).

© CBLTIC Campus del Baix Llobregat - UPC