Projecte llegit

Títol: Análisis de la interacción entre la isoforma 2 de la proteína NIEMANN-PICK C1 (NPC1-2) del melón y las proteínas de movimiento del virus del mosaico del pepino

---

Estudiant que ha llegit aquest projecte:

HOMS I BOFARULL, MARC (data lectura: 05-09-2024)
   Cerca aquest projecte a Bibliotècnica

---

Tutor/a o Cotutor/a: ROIG VILLANOVA, IRMA

Departament: DEAB

Títol: Análisis de la interacción entre la isoforma 2 de la proteína NIEMANN-PICK C1 (NPC1-2) del melón y las proteínas de movimiento del virus del mosaico del pepino

Data inici oferta: 11-10-2022      Data finalització oferta: 11-05-2023

---

Estudis d'assignació del projecte:

GR ENG SIS BIOLÒG 23

Lloc de realització:


En empresa (cal signar un conveni de cooperació)

        Tutor/a Extern: Ana Monserrat Martin Hernandez
        Institució/Empresa: IRTA-CRAG

Segon tutor/a extern: Irene Villar

Paraules clau:
Meló, isoforma 2 de la proteïna Niemann Pick C1, Virus del Mosaic del Cogombre, Proteïna de Moviment, PCR, Gateway Cloning, Complementació Bimolecular Fluorescent.

Descripció del contingut i pla d'activitats:
El Virus del Mosaic del Cogombre (CMV) és una malaltia present
arreu del món, ja que aquest es un dels més infecciosos i
destructius, capaç de causar grans pèrdues en els cultius. Aquest
a més d'afectar al cogombre també pot afectar a fruites, llegums
i hortalisses.
L'objectiu d'aquest TFG és col·laborar en un projecte que estudia
els mecanismes de resistència al virus del mosaic del cogombre
aplicat al meló.
Les tasques que es duran a terme seran experiments de clonatge de
gens en fase de gens reporters (amb transformació de bactèries i
extraccions de DNA), experiments d'expressió a la planta per
mitjà d'agroinfiltració, visualització utilitzant microscopi
confocal, expressió en bactèries i Western blot.

Overview (resum en anglès): In agriculture, one of the main responsible of many plant disease and crop losses are plant viruses.
The cucumber mosaic virus (CMV) is one of the most important plant pathogens in nature being
able to infect a wide range of plant species. Melon is not an exception, it is susceptible to CMV
infection, but a gene called cmv1 can confer resistance to at least CMV LS strain avoiding the plant
systemic infection.
Recently, the investigations of the Centre for Research in Agricultural Genomics (CRAG) have
discovered a protein that interacts with the movement proteins (MP) of the CMV. This protein
called Niemann Pick C1 (NPC1) could be the key to avoid or control the movement of the CMV from
cell to cell in melon. NPC1 also presents an isoform called NPC1-2, which is expressed in less
quantities during an infection but it may also play a role in the cell-to-cell movement.
The main objective of this project is to verify if there is an interaction between the NPC1-2 and the
MP of the CMV LS and FNY strains. In order to do it, first of all NPC1-2 interactor domain was
amplified and then it was cloned using the Gateway cloning method. Plasmids were extracted from
the generated clones and they were used to transform Agrobacterium tumefaciens, with them a
transient expression in Nicotiana benthamiana was performed in order to test the interaction using
the Bimolecular Fluorescence complementation (BiFC) technique. In the end, the BiFC showed that
there is a positive interaction between the NPC1-2 and the MP of CMV (LS and FNY), most of them
takes place near the plasmodesmata.

---