CBL - Campus del Baix Llobregat

Projecte llegit

Títol: Estudio de los genes asociados a la maduración climatérica del melón mediante el mapeo fino del locus de carácter cuantitativo MAK.10-1

Estudiant que ha llegit aquest projecte:

Tutor/a o Cotutor/a: ROIG VILLANOVA, IRMA

Departament: DEAB

Títol: Estudio de los genes asociados a la maduración climatérica del melón mediante el mapeo fino del locus de carácter cuantitativo MAK.10-1

Data inici oferta: 13-01-2024      Data finalització oferta: 13-09-2024

Estudis d'assignació del projecte:
    GR ENG SIS BIOLÒG 23

Lloc de realització:


En empresa (cal signar un conveni de cooperació)

        Tutor/a Extern: Marta Pujol Abajo
        Institució/Empresa: Centre de Recerca en Agrigenòmica (CRAG)

Segon tutor/a (UPC): CASALS MISSIO, JOAN

Paraules clau:
Millora genètica, meló, mapeig fi, QTL.

Descripció del contingut i pla d'activitats:
L'estudiant participarà en les activitats de recerca en curs de l'equip de Genetics and Genomics of Vegetable Crops del CRAG. El laboratori està enfocat a estudiar els gens que determinen la maduració climatèrica del meló. Durant les pràctiques es realitzaran experiments basats en el mapeig fi del QTL MAK10.1, realitzant una selecció de plantes F2 recombinants a partir d'una població d'uns 2000 individus. Per a la selecció, s'aplicaran mètodes moleculars basats en tècniques de genotipat de SNPs, com ara l'extracció d'ADN i la PCR al·lel específica competitiva amb encebadors dirigits a les regions genòmiques seleccionades. Durant el procés, l'alumne realitzarà la germinació de llavors, extraccions d'ADN i genotipat. Les plantes seleccionades seran trasplantades a l'hivernacle per a la producció de fruits.

Overview (resum en anglès): The melon (Cucumis melo L.) is a widely cultivated species globally, with significant economic importance thanks to the diversity of shapes, flavours and colours its different varieties. These characteristics not only give it great commercial value, but also position it as a crop of interest for both agricultural and scientific purposes. An essential process in the development of any fruit is ripening, which makes it possible to generate and disperse seeds to perpetuate the genetics of the species. In melon there are two types of ripening, the climacteric and non-climacteric; the climacteric one is characterised by the production of an ethylene peak and an increase in cellular respiration, while the non-climacteric lacks these characteristics. This contrast makes the melon a promising organism to study the fruit ripening process.
With the objective of studying the genes responsible for the melon fruit ripening, in this project a fine mapping of the quantitative trait locus (QTL) MAK.10-1 has been carried out. Through an F2 derived from an introgression line (IL) MAKR40 obtained through the enhancement of the 'Ginsen makuwa' (Makuwa) and 'Védrantais' (Ved) varieties, we will seek to delimit the region of the genome involved in the delay in ripening.
To develop the fine mapping near 5000 individuals from the F2 population were germinated and genotyped, obtaining 48 F2 recombinant individuals in the QTL region by using flanking markers. The recombinant individuals were imported into the greenhouse for the fruit development and were phenotyped for ripening-related characters.
The analysis of the recombinants allowed to delimit the QTL region to 150 kb, where 20 genes are found. Some of these have been studied in greater depth, and several potential candidates involved in the regulation of climacteric ripening of melon are suggested.
This project provides a basis for future research on the climacteric ripening of melo and the genetic harvest, with potential applications in the agronomic sector.

© CBLTIC Campus del Baix Llobregat - UPC