CBL - Campus del Baix Llobregat

Projecte llegit

Títol: Caracterització de gens d'arròs involucrats en la resposta de mort cel·lular programada induïda en resposta a la infecció per Magnaporthe oryzae

Estudiant que ha llegit aquest projecte:

Tutor/a o Cotutor/a: SORRIBAS ROYO, FRANCISCO JAVIER

Departament: DEAB

Títol: Caracterització de gens d'arròs involucrats en la resposta de mort cel·lular programada induïda en resposta a la infecció per Magnaporthe oryzae

Data inici oferta: 05-02-2024      Data finalització oferta: 29-02-2024

Estudis d'assignació del projecte:
    GR ENG SIS BIOLÒG 23

Lloc de realització:


En empresa (cal signar un conveni de cooperació)

        Tutor/a Extern: Núria Sanchez Coll
        Institució/Empresa: Centre de Recerca en Agrigenòmiques CRAG

Paraules clau:
Nteracció planta-patògen, Arròs, Fongs, Mort cel·lular programada, Metacaspases.

Descripció del contingut i pla d'activitats:
El treball se centrarà en la caracterització funcional d'una família de gens d'arròs, les metacaspases, durant la mort cel·lular programada induïda en resposta a la infecció pel fong Magnaporthe oryzae. L'estudiant clonarà els gens i els expressarà en llevat per tal de dur a terme estudis funcionals de complementació i desagregació proteica fent servir un sistema reporter de carboxipeptidasa. D'altra banda, estudiarà la funció d'aquests gens en plantes transgèniques d'arròs que expressen diversos membres d'aquesta família sota el control de diversos promotors i fusionats a proteïnes fluorescents mitjançant tècniques fitopatològiques i de microscopia.

Overview (resum en anglès): Abstract
This Final Degree Project (TFG) focuses on the study of type I metacaspases from rice (Oryza sativa)
and their ability to degrade the aggregated protein ¿ssCPY*-Leu2-myc in yeast (Saccharomyces
cerevisiae), as well as the quantification of protein aggregation formation of Rice Metacaspase I in
Nicotiana benthamiana. Metacaspases are proteases homologous to animal caspases and play a
crucial role in stress responses and the regulation of programmed cell death in plants. The main
objective is to analyze the functionality of rice metacaspases in the degradation of misfolded
proteins and the formation of protein aggregates, in a yeast model and tobacco plants respectively.
To achieve this, GreenGate cloning techniques are used to introduce the genes of interest into the
appropriate vectors, followed by transformations in yeast and plants. PCR assays, gel
electrophoresis, western blot, and fluorescence assays were performed to quantify protein
aggregates. The expression and functionality of the metacaspases were analyzed using molecular
biology and biochemistry techniques. The results obtained are not conclusive to confirm that type
I rice metacaspases can degrade the ¿ssCPY*-Leu2-myc protein in yeast.
At the contrary, in Nicotiana benthamiana, it was observed that mutations of the IDRs (Intrinsically
Disordered Regions) cause significant changes in the aggregation of the OsMC1 protein, highlighting
its potential in regulating cellular processes through aggregate formation. Such studies offer new
perspectives on the functionality of metacaspases in different biological contexts and may
contribute to the development of new strategies in plant biotechnology.
This TFG provides an overview of the work carried out to analyze the mechanisms of action of
metacaspases in protein degradation and aggregation, integrating knowledge of molecular biology,
biochemistry, and biotechnology.

© CBLTIC Campus del Baix Llobregat - UPC