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Projecte llegit

Títol: Mejora genética del melocotonero: introgresiómica con especies emparentadas (Prunus davidiana)

Estudiant que ha llegit aquest projecte:

Tutor/a o Cotutor/a: CASALS MISSIO, JOAN

Departament: DEAB

Títol: Mejora genética del melocotonero: introgresiómica con especies emparentadas (Prunus davidiana)

Data inici oferta: 26-06-2024      Data finalització oferta: 26-02-2025

Estudis d'assignació del projecte:
    GR ENG SIS BIOLÒG 23

Lloc de realització:


En empresa (cal signar un conveni de cooperació)

        Tutor/a Extern: Iban Eduardo
        Institució/Empresa: CRAG Centre de Recerca en Agrigenòmica

Paraules clau:
Millora genetica, oïdi, mapeo fino, préssec

Descripció del contingut i pla d'activitats:
Se aplicará la estrategia MAI (Mejora de la Adaptabilidad e Integración) para incrementar la variabilidad genética de los melocotoneros mediante la introducción de nuevos rasgos genéticos de Prunus davidiana. Continuando con los trabajos anteriores en las poblaciones BC1 (NT1Ba y NT1Ca), se avanzará en el desarrollo y análisis de la población NT2Ca. Se realizarán cruces entre el cultivar de melocotón 'Nectatop' y los híbridos P. persica x P. davidiana ('Cadaman' y 'Barrier') para obtener progenies BC2. Estas progenies serán seleccionadas utilizando una matriz de SNP Fluidigm, basada en datos de resecuenciación de las líneas parentales. Las poblaciones serán evaluadas en términos de fenología, calidad de la fruta, morfología de las hojas y resistencia a enfermedades, con el objetivo de identificar genes útiles de *P. davidiana*. Se llevará a cabo un análisis de QTL para identificar regiones genómicas relacionadas con características como la forma de la hoja, la fecha de madurez y el sabor amargo de la pulpa. Los resultados de esta investigación contribuirán a la identificación de nuevos alelos de interés para programas de mejoramiento de melocotón.

Overview (resum en anglès): Peach (Prunus persica) is a crop of great economic and agronomic importance in temperate regions. However, its susceptibility to diseases such as powdery mildew, caused by the fungus Podosphaera pannosa, negatively affects fruit quality and nursery production. Although fungicides are commonly used for its control, their intensive application leads to negative environmental impacts. A sustainable alternative is the development of resistant varieties through the introgression of resistance genes from wild species, which would reduce the use of chemical inputs and contribute to a lower environmental impact in agriculture.
Prunus davidiana, a wild relative of peach, shows natural resistance to powdery mildew. The aim of this study was to identify and narrow down the genomic position of the resistance gene, named Vr4, through fine mapping. For this purpose, individuals from the NT2BaS1 population,obtained by self- pollination of second-generation (BC2) interspecific hybrids between P. persica and P. davidiana, were used.
A total of 670 individuals were genotyped using flanking single nucleotide polymorphism (SNP) markers defined based on the candidate region identified in previous studies, which enabled the selection of 15 informative recombinants. In addition, these individuals were phenotyped to correlate genotype with resistance to powdery mildew. The candidate region previously defined spanned 344 kb, between positions 4,133,341 bp and 4,477,235 bp. As a result of this study, the candidate region was reduced to 68 kb, between positions 4,133,341 bp and 4,201,835 bp. This narrowing allowed the number of candidate genes to be reduced from 23 to 9.
These results provide a solid foundation for future studies aimed at the precise identification of the Vr4 gene. The newly defined interval will allow for the design and use of more specific markers within this region, facilitating its localization and subsequent incorporation into breeding programs focused on developing powdery mildew resistant peach varieties.

Aquest projecte està relacionat amb l'adaptació al Canvi Climatic? Sí

Aquest projecte està relacionat amb la digitalització del seu àmbit de treball? No

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