Projecte ofert

Títol: Estudi de la funció de la metacaspasa AtMC1 en la immunitat vegetal

---

Per assignar-vos el projecte us heu de dirigir al tutor/a o cotutor/a perquè us l'assigni.

---

Tutor/a o Cotutor/a: ROIG VILLANOVA, IRMA

Departament: DEAB

Títol: Estudi de la funció de la metacaspasa AtMC1 en la immunitat vegetal

Data inici oferta: 22-06-2026      Data finalització oferta: 22-02-2027

---

Estudis d'assignació del projecte:

DG ENG SBIO-ENG ALIM

Lloc de realització:


En empresa (cal signar un conveni de cooperació)

        Tutor/a Extern: Núria Sánchez Coll
        Institució/Empresa: Centre de Recerca en AgriGenòmica (CRAG)

Segon tutor/a extern: Joel Ayet

Paraules clau:
Immunitat vegetal, Metacaspases, AtMC1, Interaccions proteïna¿proteïna, Proteòmica (N¿terminòmica), Biologia estructural

Descripció del contingut i pla d'activitats:
Antecedents
La millora de la resistència de les plantes a patògens és un repte clau en agricultura, amb impacte directe en la productivitat i la sostenibilitat dels cultius. Entendre els mecanismes moleculars que regulen la resposta immune vegetal és essencial per desenvolupar noves estratègies de protecció de plantes.

En aquest context, el projecte se centra en desxifrar el mecanisme d'acció de la metacaspasa AtMC1 en la immunitat vegetal, combinant aproximacions experimentals i computacionals. Fins ara, s'han identificat candidats a substrats/interactors mitjançant proteòmica N'terminòmica (COFRADIC) i s'han dut a terme validacions inicials d'interacció i processament. Paral·lelament, el modelatge estructural amb AlphaFold i dinàmica molecular ha permès proposar estats conformacionals i possibles interfícies funcionals rellevants. Actualment, el projecte es troba en fase de validació experimental dels candidats i d'integració funcional entre estructura, localització subcel·lular i activitat biològica.

Proposta de treball
L'estudiant de TFG s'integrarà en el desenvolupament experimental orientat a la validació de substrats i interactors d'AtMC1. El seu treball se centrarà en donar suport a assaigs d'interacció proteïna'proteïna (co'IP en sistemes com Nicotiana benthamiana), estudis de colocalització mitjançant microscòpia confocal i anàlisi funcional en plantes model. Participarà en la preparació de mostres per a assaigs bioquímics (com Western blot i assaigs d'activitat amb proteïna recombinant), així com en el seguiment de línies transgèniques o editades rellevants per al projecte. Progressivament, també es familiaritzarà amb l'anàlisi bàsica de dades, contribuint a la interpretació de resultats en coordinació amb l'equip. El treball es desenvoluparà en un entorn altament col·laboratiu i multidisciplinari, amb interacció amb investigadors del grup i col·laboradors externs.

Competències que adquirirà

Tècniques:

Tècniques de biologia molecular i cel·lular en plantes (clonatge, expressió transitòria, treball amb Arabidopsis i Nicotiana)
Assaigs d'interacció proteïna'proteïna (co'immunoprecipitació)
Microscòpia confocal i anàlisi de colocalització
Tècniques bioquímiques bàsiques (extracció de proteïnes, Western blot, assaigs d'activitat)
Introducció a l'anàlisi de dades experimentals
Transversals (soft skills):

Comunicació científica en anglès (llengua de treball del laboratori)
Presentació i discussió de resultats en reunions de grup
Pensament crític i resolució de problemes experimentals
Treball en equip en un entorn internacional
Organització del treball i gestió del temps en un projecte de recerca

Orientació a l'estudiant: Bases de biologia molecular (ADN, proteïnes, expressió gènica)
Fonaments de biologia vegetal
Coneixement bàsic de tècniques de laboratori (pipeteig, preparació de mostres)
Nocions bàsiques de bioquímica de proteïnes
Anglès científic fluit (comprensió lectora i comunicació oral)
Coneixements bàsics d'organització i registre de dades experimentals

---